Compte rendu du 20/01/2021
Compte rendu du 20/01/2021
Présents:
F Auger, O. Beuf, R Boldos, F. Delmas, T Delzescaux, F Desmoulin, M Dojat, N. Durieux, PA Eliat, F Franconi, M. Kain, F. Kober, B. Lemasson, Yann le Fur, G. Leroux, H Mathieu, M Naveau, C Po, S Pop, E Ribot, M Santin, L Soustelle, A Traoré, A Trotier, C. Wary Excusés : S. Mériaux
Avancées des actions en cours
- retours sur le wiki : https://github.com/sain-imaging/wiki-sain ou https:// github.com/SAIN-IMAGING/wiki-sain => un grand merci à Aurélien pour cet excellent travail.
Groupe de travail pour l’organisation du WIKI : Pierre-Antoine, Benjamin, Lucas, Mathieu, Aurélien.
Suggestions : Mettre les CR des réunions dans une rubrique spécifique Voir pour faire un espace de stockage (ex googleDrive) Veiller à éviter les duplications avec le forum Bruker. Voir la mécanique pour un wiki ouvert pour le partage de données, outils, sequences à la communauté : Notions de Pages publiques et Pages privées.
- recensement des items nécessaires pour le stockage et l’interrogation des données d’imagerie préclinique. Le fichier est ici
- recensement des pipelines de traitement les plus utiles Voir wiki. https://github.com/SAIN-IMAGING/WIKI-SAIN/blob/main/Logiciel_SAIN.md Sorina propose l’integration dans VIP de pipelines à exécuter et partager
- Vie du réseau Liste diffusion et le Wiki permettent le partage et stimulent les échanges. Mise en place de cours/workshop
- sur le traitement des données SA de l’acquisition au traitement. - sur le développement de sequences.
- à définir le contenu, la fréquence, le public visé.
- une prochaine réunion dédiée à cela (11/03) Points Divers : Claire Wary : Espace d’échanges Bruker : partie forum (sur https://discourse.julialang.org/ ) gérée de façon communautaire distincte de la partie fermée modérée par Bruker sur des compléments d’information entre utilisateurs Bruker. Un retour sur la mise en place d’ici quelques mois.
Mathieu S : un WS sur les avancées en imagerie préclinique se met en place à l’ICM pour fin d’année 2022. Le SAIN sera mis à contribution.
Prochaine RU: 11 Mars 2022 9h-11h
ODJ : la mise en place de WS/cours/TD sur les données petit animal de l’acquisition à l’analyse.