Compte rendu du 27/10/2023 | Small Animal Imaging Network
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Compte rendu du 27/10/2023

Compte rendu du 27/10/2023

CR réunion SAIN du 27 Octobre 2023 10h-12h

Présents :

Note : pas mal d’absents car congrès cardio en parallèle

  • Denis Grenier
  • Vincent Noblet
  • Benjamin lemasson
  • Pierre-Antoine Eliat
  • Yann Le Fur
  • Mikaël Naveau
  • Clémence Leboullenger
  • Lucas Soustelle
  • Florence Franconi
  • Hervé Mathieu

Ordre du jour

  • Discussion formation sur préparation échantillons ex vivo
  • Réponse potentielle à l’appel d’offre FC3R
  • Discussion sur un retour à faire à Bruker concernant la gestion de sub-versions de PV360
  • Relance Shanoir ?
  • Possibilité de mettre à jour les listes des équipements plateformes et des séquences partageables

Compte-Rendu

Organisation aperoWEB SAIN : discussion produit fluoré / préparation des échantillons ex-vivo

  • Proposition de date jeudi à 13h/14h : 11/12/18/19 octobre et aussi un mercredi avant Denis Grenier
  • Session à enregistrer
  • L’initiateur de la discussion se charge de rédiger un CR
  • Préparation de quelques questions à mettre sur le wiki Aurélien

Problème de PV360.x

  • Lettre ouverte à Bruker sur la problématique des modifications fréquentes de PV360.x -> A compléter et à poster sur le forum PCI avant les vacances SAIN + Denis Grenier
    • Problématique des gestions de comptes
    • Le format des rawdatas changent souvent
    • Développement : problème de compilation sous tout les formats
    • PV360.x est une beta, on devrait avoir accès aux corrections de bug
    • Fonctionnalité disparaissent entre les versions
  • Lucas a discuté avec Florence Delmas :
    • Avoir accès à des environnements de développement pour toutes les versions
    • A l’achat d’une license, les futures versions sous 1/3/5 ans sont incluses
    • Quid des licenses pour les versions en dessous ?

Appel d’offre FC3R Denis Grenier

  • https://www.fc3r.com/financement-de-projets.php
  • Deadline 24 Novembre 10 pages
  • Pas possible de mettre plus de 30% de la demande sur des ressources RH mais possible de demander des financements pour des prestations (dans lesquelles il y aura du temps RH)
  • Idée de projet
  • Base d’image à différents champs (4.7T / 7T / 9.4T)
  • Faciliter le dépôt
  • Faciliter la réutilisation / homogénéisation
  • Mettre en avant la première étude de relaxométrie
  • Transformer le Allen template vers le contraste de ton image pour faciliter le recalage
    • Diminution de la variance etc
    • Pas besoin d’acquisition sur les animaux sains
  • base de travail d’odasai à récupérer
  • Rédaction sur google doc

Shanoir preclinique

  • Démo à faire pour créer un compte et un projet pour partager un jeu de donnée anatomique T1w et T2w par centre du SAIN (Cerveau / Abdo)
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