Compte rendu du 18/04/2024

CR réunion SAIN du 18 avril 2024 10h-12h

Présents :

Environ 20 participants

Ordre du jour

• Présentation scientifique par Aurélien Trotier :

  Accelerated 3D Multi-Echo Spin-Echo sequence with a subspace constrained reconstruction for whole mouse brain T2 mapping

• Aperoweb
• Retour réunion bruker
• Organisation congrès SAIN
• Problème lit cryo et impression 3D

Compte-Rendu

Présentation scientifique

• Séquence accélérée 3D de T2 mapping
• Séquence disponible pour PV6.0.1 sur demande à aurelien.trotier@rmsb.u-bordeaux.fr
• Package de reconstruction disponible https://github.com/aTrotier/PAPER_subspace_MESE

  aperoWEB SAIN : Discussion produit fluoré / préparation des échantillons ex-vivo

• Compte-rendu de Denis Grenier : https://github.com/orgs/SAIN-IMAGING/discussions/27
• Point intéressant qui a été testé : fécule de pomme de terre
  • Denis Grenier a effectué des premiers tests qui sont concluent
  • Protocol disponible dans l’article : https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004222019678
• Le topic dans la discussion peut aussi servir pour regrouper des questions sur ce sujet

Retour réunion Bruker

Paul Freitag (Bruker) était présent durant la réunion :

• La plupart des utilisateurs ont de nombreux comptes utilisateurs
  • Proposition Florence Franconi
    • Partage des données / protocole sans utiliser le share (mdp ?)
  • Proposition Denis Grenier :
    • Avoir un répertoire dédié public dans les protocoles (exemple : Bruker / User / public protocols)
• Question Aurélien Trotier : Développement d’un interpreter Pulseq pour Bruker ?
  • Visite de la team pulseq chez Bruker-> Pas de ressource disponible par Bruker pour développer cela en interne.
  • Pulseq résoudrait le soucis de partage entre version, il faudrait juste adapter l’interpréteur pour les version PV360.X
  • NOTE perso : Est-ce qu’une collaboration est possible pour développer / maintenir cela par quelques utilisateurs / laboratoires / SAIN ? Demande de financement ?
• Proposition Paul Freitage : Est-ce que l’on veut participer à la collecte de données pour améliorer PV ?
  • Sondage : Sharing PV usage : Would you allow automatic sharing of PV usage and workflow information with Bruker if you could? (Yes - No)
    • Yes : 3 / No : 5
  • Remarque diverses :
    • Automatiquement, c’est un problème is an issue
    • Mieux d’avoir une interaction en direct que juste des récuparations
    • Bruker a déjà des retours par Ingénieur ou des mails
    • Discussion between application Engineer (Claire, Jerome) and Software team : Intermediate people -> lose information
• Possibilité d’avoir des datasets standard pour chaque version
  • Paul est d’accord mais il faut lister les acquisitions principales
  • Ouverture d’un topic sur le forum pour toute la communauté

Organisation meeting SAIN

• A l’ICM en Novembre ou Décembre (Après l’ESMRM)

Discussion libre

• Bruker est au courant du problème du lit cryo

TO DO