Compte rendu du 18/09/2025 | Small Animal Imaging Network
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Compte rendu du 18/09/2025

Compte rendu du 18/09/2025

Compte rendu réunion SAIN du 18 septembre 2025

Ordre du jour

  • ESMRMB
  • Nouveau site web
  • Organisation du webinaire impression 3D
  • Groupes de travail (GT)
  • Problème de quench : GPRS ?
  • Trouver un nom pour les webinaires (AperoWeb ?)
  • Comité d’éthique invalidé : pourquoi ? retour à la normale ?
  • Pulseq interpreter : fonctionnement à valider
    • Partage du code source nécessaire (visibilité)
    • Matthew Budde a déjà envoyé un mail
  • Nouvelle réunion avec Bruker (proposée en avril 2024)
  • Mise à jour de la liste du consensus matériel
  • Mailing list Renater

Compte rendu

Présents : 16 membres

Présentation du nouveau site web

  • Disponible à l’adresse : https://sain-imaging.github.io/
  • Le site web peut servir de point de rendez-vous pour tous, permettant de :
    • retrouver les comptes rendus
    • effectuer des recherches
    • publier des annonces sur les actions du SAIN et des laboratoires (exemple : partage de séquence ou mise à jour)
  • Tous les membres peuvent ajouter des posts en :
    • créant un fichier .md dans le dossier _posts du dépôt https://github.com/SAIN-IMAGING/sain-imaging.github.io
    • nommant le fichier au format : YYYY-MM-DD-{nom} (pour les CRs : 2021-01-20-CR-20210120.md)
    • complétant l’en-tête puis rédigeant le post

Exemple d’en-tête :

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layout: post
title: "Compte rendu du 20/01/2021"
categories: [Réunion]
tags: [compte-rendu]
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  • Possibilité d’ajouter une carte interactive pour visualiser les matériels présents sur chaque site
  • ATTENTION : le site est en accès ouvert, pour les sujets sensibles il faudra renvoyer vers un compte-rendu offline (à réfléchir : RESANA ou Github)

Pulseq

  • L’initiative d’interpréteur Pulseq progresse rapidement grâce à l’aide de Matthew Budde.
  • Il a rejoint le projet suite à l’ouverture d’un topic sur le forum PCI de Bruker, porté par le réseau SAIN.
  • Les premières images d’une séquence 2D GRE ont été obtenues sous PV360-3.5 image-pulseq
  • Il serait idéal d’ouvrir le répertoire en public pour favoriser la participation (le code Bruker visible n’est plus très utile).
  • Liens importants :
    • Interpréteur (privé) : https://github.com/mdbudde/bruker_pulseq_private/
    • Utilitaires pour la définition des séquences et reconstructions : https://github.com/aTrotier/bruker_pulseq_utils/

Suivi des IRMs à distance

Arrêt du système GPRS

  • Le système GPRS a été arrêté depuis plus d’un an.
  • Bruker n’a pas proposé de solution de remplacement et les rappels sur l’arrêt du système ont été très limités.
  • L’IRM 4.7T du CRMSB a quenché en partie à cause de cela.

    Solutions disponibles

  • Avis général : le système Bruker sur la BMU5 fonctionne plutôt bien.
  • Denis Grenier : utilisation d’une perche à selfie + application Alfred pour visualiser les messages sur le BMU.
  • Radu Boldos : mise en place d’une puce GSM qui envoie un SMS/appel en cas de problème (antenne déportée à l’extérieur).

Note : Lors du passage en eau perdue, seule la sauvegarde de la tête froide est assurée.

Pannes des cryosondes

  • La panne d’un canal sur la cryosonde est un problème récurrent (CRMSB / IRMaGE).
  • Immobilisation très longue (> 6 mois).
  • Pas de retour de Bruker sur la cause des pannes.
  • Liste des pannes :
    • IRMaGE : 3 fois en 6 ans
    • CRMSB : 1 fois en 1 an et demi
    • CRMBM : 1 fois
    • IRIS : aucun souci en 4 ans
    • PiLoT : aucun souci
  • Demander à Bruker des retours sur les pannes de cryosonde ? Possibilité d’obtenir une antenne de prêt ?

Réglementation d’expérimentation animale

  • Invalidation des comités d’éthique : problème de documents administratifs
  • Transfert des DAPs possible entre établissements au niveau du ministère
  • Le SAIN pourrait regrouper des informations pour l’expérimentation :
    • Liste des animaux nécessitant une DAP

      Développement des séquences sur différentes versions

  • Certains laboratoires disposent de machines de développement (CRMSB / CREATIS-PiLoT).
  • Pour transférer des séquences, il serait utile que les autres membres du SAIN puissent se connecter à distance.
  • Proposition :
    • Teamviewer (demander à FLI de financer quelques licences)
    • RustDesk ?

TO DO

  • Nouvelle liste de diffusion : sain@groupes.renater.fr
  • Organiser en novembre le webinaire impression 3D (Denis)
  • Créer de nouveaux fichiers exploitables :
    • Parc IRMs
    • Compétences/spécificités des laboratoires
    • Matériel en prêt / dons disponibles
  • Demander à Bruker l’ouverture publique du projet Pulseq
  • Demander à FLI de financer des licences ?
  • Prochain ordre du jour : pannes de cryosonde si Bruker est disponible
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