Compte rendu du 09/04/2026 | Small Animal Imaging Network
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Compte rendu du 09/04/2026

Compte rendu du 09/04/2026

Compte rendu réunion SAIN du 09 Avril 2026

Ordre du jour

  • Modification du Bureau : départ de Benjamin Lemasson et arrivée de Vasile Stupar
  • Présentation rustdesk
  • Hardware seconde main
  • Metadata : consensus paper

Liens internes resana


Compte-rendu

Vie du réseau : Évolution du Bureau

Le réseau SAIN enregistre une modification dans la composition de son bureau :

  • Benjamin Lemasson se retire de celui-ci mais reste un membre actif du réseau.
  • Vasile Stupar rejoint l’équipe du bureau pour renforcer les actions de coordination nationale.

Outils collaboratifs : Déploiement de RustDesk

Sous l’impulsion de Denis Grenier, la solution RustDesk a été déployée pour faciliter l’accès à distance aux stations d’acquisition Bruker des centres volontaires.

Son utilisation permettra de fluidifier le développement partagé de séquences et renforcer l’entraide technique inter-sites (dépannage, conseils de programmation).

Un mode opératoire sur Resana : https://resana.numerique.gouv.fr/public/perimetre/consulter/1302885?information=46855085

État du déploiement :

  • Lyon, Marseille & Bordeaux : Opérationnels (ouverture des ports réseau effectuée).
  • Grenoble : Migration des machines vers un nouveau sous-réseau en cours pour résoudre des contraintes de proxy.

Gestion et prêt de matériel : “Matosthèque” pour l’IRM

Le réseau engage une réflexion sur la gestion durable du matériel scientifique. Face aux limites de la “Bourse aux matériels” du CNRS (accessibilité restreinte aux membres du CNRS et usage complexe), le projet Matosthèque est identifié comme une alternative pertinente.

L’initiative Mastothèque semble être une approche qui pourrait convenir car elle peut-être auto-hébergées :

Liens et documentations :

Pistes de réflexion :

  • Exploration des solutions d’hébergement via le Cloud Recherche du CNRS. https://ods.cnrs.fr/cloud-recherche.php
  • Proposition d’une gestion centralisée par France Life Imaging (FLI) pour offrir un cadre administratif stable et limiter les conflits entre les tutelles.
  • Mise en place de conventions types de prêt ou de don pour sécuriser les transferts entre laboratoire.
  • Priorité initiale : matériel spécifique à l’IRM clinique et préclinique.

Standardisation : Groupe de travail sur les Métadonnées

Dans la continuité des travaux du groupe EMIM sur la standardisation des metadatas d’imagerie, le réseau SAIN poursuit sa réflexion sur la définition d’un consensus pour l’IRM.

Le SAIN a déjà commencé une réflexion et a généré un document qu’il faudrait compléter : Travail initial de définition par le SAIN disponible sur ici sur RESANA

Ressources : Le livre blanc sur l’utilisation secondaire des données est disponible pour consultation.

Discussion :

  • En IRM préclinique (Bruker) le fichier Method et acqp et visu_pars stocke la plupart des metadatas. Peut-être TROP pour envisager un partage ?
  • Il n’y a pas de code associé avec le type d’image (foie etc)
  • Le type d’antenne semble être une metadata importante
  • Les métadatas des fichiers ne sont pas adapté pour l’entraînement IA
  • Une nouvelle version de brkraw (conversion des données en NIFTI) permet de définir des modules. Il peut-être intéressant de définir une liste permettant de générer un fichier exploitable de métadata https://brkraw.github.io/getting-started/bids.html. La discussion doit se faire sur le forum Bruker pour obtenir un consensus

Focus Technique : Reconstruction temps réel (Etienne Langevin)

Etienne Langevin a présenté ses travaux sur l’optimisation des pipelines de reconstruction pour le guidage par ultrasons (US).

Innovation : Modification de la chaîne de reconstruction native pour router les données vers une station externe.

Application : Permet une reconstruction ultra-rapide et un rétrocontrôle (feedback) dynamique pour le pilotage des ultrasons en temps réel.


Actions à venir (To-do list)

  • Organisation d’une session dédiée à la “Matosthèque” et à l’économie circulaire (Coordination : Sabrina Doblas).
  • Lancement d’un fil de discussion sur le forum Bruker concernant la définition des métadonnées (en s’appuyant sur les capacités du projet brkraw).
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